Ginjal memiliki kelainan struktural seperti pembengkakan ginjal, perubahan posisi dan penampilan. Kelainan ginjal juga dapat timbul karena terbentuknya batu di ginjal. Saat ini, untuk mengenali batu ginjal masih membutuhkan waktu yang cukup lama. Hal ini dapat diatasi dengan pelaksanaan teknik segmentasi batu ginjal yang baik pada citra CT Scan. Segmentasi yang akurat dari lokasi dan luas batu ginjal memainkan peran penting dalam diagnosis batu ginjal. Perlu algoritma yang efisien untuk segmentasi batu ginjal. Preprocessing diperlukan untuk meningkatkan masukan citra CT Scan. Proses preprocessing citra CT Scan dimulai dari tahap preprocessing gambar CT Scan menggunakan metode region of interest (ROI). Tahap ini dilakukan untuk mengambil atau memisahkan area ginjal dengan area tulang yang terdapat di dalam citra. Hal ini perlu dilakukan karena citra tulang memiliki kemiripan dengan citra batu ginjal. Tahap selanjutnya adalah median filtering. Tahap ini dilakukan untuk mempertahankan batas tepi dari citra batu ginjal. Kemudian dilakukan thresholding untuk memisahkan batu ginjal dengan area ginjal. Terakhir dilakukan perhitungan luas batu ginjal yang ada di organ ginjal. Segmentasi yang akurat berpengaruh terhadap proses pengukuran luas batu ginjal. Pada tugas akhir ini, akan dilakukan perbaikan citra CT Scan ginjal kemudian dilakukan segmentasi untuk memisahkan citra CT Scan ginjal. Dengan metode yang diusulkan pada proyek akhir ini dapat memberikan solusi segmentasi dan pengukuran luas batu ginjal pada citra CT Scan ginjal dengan nilai rata-rata error yang terjadi pada penghitungan luas batu ginjal adalah 13.78%. Hal ini terjadi karena hasil segmentasi yang belum sempurna. Sehingga berpengaruh pada hasil dari perhitungan luas.