Perkembangan teknologi komputer terus berkembang dan sangat berpengaruh pada kehidupan manusia untuk semua bidangnya termasuk bidang kesehatan. Penyakit yang disebabkan oleh virus dan bakteri sanagat rentan terjadi pada anak. Selain itu juga sangat berbahaya karena penyebarannya terjadi dengan cepat. Keterlambatan penanganan dan pengobatan penyakit dapat menyebabkan komplikasi yang lebih parah dan sulit disembuhkan. Biaya untuk berkonsultasi dengan ahli semakin mahal. Oleh karena itu orang tua memmerlukan sistem yang memiliki kemampuan sebagai ganti seorang ahli untuk dapat mendiagnosis penyakit yang terjadi. Pada penerapannya, sistem pakar ini bertindak sebagai konsultan yang dapat menjelaskan langkah – langkah dan tujuan yang nantinya mengahsilkan keputusan dan kesimpulan. Pada penelitian ini akan membahas pembuatan aplikasi system pakar penyakit infeksi virus dan bakteri yang menular pada anak berbasis web menggunakan metode certainty factor (CF) atau factor kepastian. System pakar diagnosis penyakit menular pada anak dibangun untuk diagnosis penyakit tropis yang disebabkan infeksi virus dan bakteri. System ini memberikan informasi tentang diagnosis, penanganan dini yang dapat dilakukan dan pencegahan. Metode pelacakan dilakukan dengan mencari gejala yang terjadi pada masing – masing diagnosis berdasarkan basis pengetahuan dan rule yang telah disimpan.