Pembayaran sekolah meliputi pembayaran uang iuran komite rutin atau SPP dan pembayaran lainnya mempunyai peran penting dalam aktivitas sekolah. Didalam aktivitas tersebut SMA N 1 Sukomoro sistem pembayarannya saat ini masih dilakukan secara manual. Data – data pembayaran sekolah disimpan dalam bentuk berkas, sehingga kurang efektif dan efisien. Karena itu perlu adanya peningkatan sistem secara komputerisasi pada pencatatan laporan pembayaran sekolah di SMA N 1 Sukomoro. Untuk itu tujuan penelitian ini adalah membuat sistem aplikasi pembayaran sekolah meliputi SPP dan pembayaran lainnya yang bertujuan untuk meningkatkan keakuratan, kecepatan, serta memudahkan dalam proses pembayaran dan supaya sistem aplikasi ini memberi dukungan pada kelancaran tugas bagian administrasi dan memberikan informasi biaya siswa dengan hak login siswa. Pembuatan aplikasi pembayaran sekolah ini berbasis web dengan MySQL sebagai databasenya. Sesuai dengan tujuan penelitian, maka penelitian ini dilakukan dengan metode analisis, perancangan sistem dan pembuatan pogram. Objek penelitian ini adalah SMA N 1 Sukomoro Magetan. Kesimpulan yang diperoleh dari aplikasi pembayaran sekolah ini yaitu dapat melakukan pencatatan dan pencarian data siswa, history kelas siswa, biaya perkelas dan persiswa, data transaksi pembayaran, beasiswa, alokasi beasiswa, history beasiswa,keterlambatan pembayaran, serta mencetak rekap pembayaran dalam bentuk laporan.